Struttura del corso

Introduzione al linguaggio di programmazione Python

  • Perché Python?
  • Utilizzo di Python per trattare dati biologici
  • Lavorare con la shell iPython
  • Il tuo primo programma
  • Scrittura di Python script
  • Importazione di moduli

Lavorare con proteine e sequenze di RNA/DNA

  • Trovare i motivi
  • Trascrizione e traduzione in silico
  • Gestione dei tracciati delle sequenze

Analisi dei dati in diversi formati biologici

  • Analisi di FASTA
  • Conversioni di formati di dati

Esecuzione di analisi biologiche

  • ESPLOSIONE
  • AccessServizi Web Biologici

Trattare le strutture biologiche 3D utilizzando Python

Python facilita l'analisi statistica

Visualizzazione dei dati

  • Creazione di grafici a barre e a dispersione
  • Calcolo di un'area sotto curva (AUC)

Utilizzo di file .xls e .csv

  • Importazione ed esportazione di dati da MS Excel / OpenOffice Calc
  • Scrittura di file .xls e .csv

Utilizzo di Python per creare una pipeline di elaborazione dei dati automatizzata

Requisiti

Conoscenze biologiche di base sulle sequenze di proteine, RNA e DNA.

 28 ore

Numero di Partecipanti



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