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Struttura del corso
Introduzione al linguaggio di programmazione Python
- Perché Python?
- Utilizzo di Python per trattare dati biologici
- Lavorare con la shell iPython
- Il tuo primo programma
- Scrittura di Python script
- Importazione di moduli
Lavorare con proteine e sequenze di RNA/DNA
- Trovare i motivi
- Trascrizione e traduzione in silico
- Gestione dei tracciati delle sequenze
Analisi dei dati in diversi formati biologici
- Analisi di FASTA
- Conversioni di formati di dati
Esecuzione di analisi biologiche
- ESPLOSIONE
- AccessServizi Web Biologici
Trattare le strutture biologiche 3D utilizzando Python
Python facilita l'analisi statistica
Visualizzazione dei dati
- Creazione di grafici a barre e a dispersione
- Calcolo di un'area sotto curva (AUC)
Utilizzo di file .xls e .csv
- Importazione ed esportazione di dati da MS Excel / OpenOffice Calc
- Scrittura di file .xls e .csv
Utilizzo di Python per creare una pipeline di elaborazione dei dati automatizzata
Requisiti
Conoscenze biologiche di base sulle sequenze di proteine, RNA e DNA.
28 ore
Recensioni (1)
L'accesibilit del formatore e la capacità di comunicare in modo molto efficace,
Ciprian Ilie - Institutul National de Sanatate Publica
Corso - Programming for Biologists
Traduzione automatica