Corso di formazione Sequenziamento Genetico e Test

Questo è un workshop pratico che introdurrà i fondamenti della bioinformatica. È rivolto a persone con una base biologica di base e conoscenze in biologia molecolare, che desiderano imparare come elaborare e lavorare con dati biologici utilizzando strumenti computazionali. È stato progettato in modo particolare per:

• Ricercatori che lavorano nei laboratori sperimentali su macromolecole biologiche, proteine, ARN e DNA.
• Scienziati il cui campo di competenza principale non è la biologia, ma che devono gestire dati biologici.
• Gestori che introducono nuovi prodotti (ad esempio farmaci), e desiderano allargare le proprie conoscenze sulla bioinformatica attuale.
• Programmatori informatici che intenderanno scrivere programmi per gestire molecole biologiche.

Il corso è suddiviso in due parti: teorica e pratica. La lezione si alterna con semplici esercizi pratici, quiz e test per garantire che i partecipanti comprendano i concetti.

Durante il training vi guideremo in un tour dettagliato che copre tutti gli aspetti fondamentali dell'analisi dei dati biologici. Questo workshop è l'opportunità ideale per familiarizzare con la bioinformatica e le sue molteplici sfaccettature! Alla fine, dovreste essere in grado di affrontare qualsiasi problema di base di bioinformatica: saprete dove ottenere i dati necessari, come reperire informazioni rilevanti e come funzionano software e algoritmi di base. Il nostro obiettivo è facilitare la vostra comprensione dei dati biologici.

Al termine del corso sarete in grado di lavorare con i dati biologici utilizzando strumenti di bioinformatica.

Buona Pratica Clinica (GCP) è un insieme di linee guida per la ricerca clinica su soggetti umani. GCP costituisce lo standard internazionale per la progettazione, conduzione, monitoraggio, documentazione, analisi e segnalazione degli esperimenti clinici.

In questo corso guidato dal formatore, i partecipanti impareranno le linee guida più importanti e i principi fondamentali applicati nella Buona Pratica Clinica (GCP) per gli esperimenti clinici e le ricerche che coinvolgono soggetti umani. Il corso fornisce un panorama generale delle diverse aree GCP, ma presta una leggera maggiore attenzione alla GCP centrica ICH per i farmaci sperimentali e i biologici.

Al termine di questo training, i partecipanti saranno in grado di:

• Capire i principi fondamentali della GCP per i farmaci sperimentali e i biologici sulla base della Conferenza Internazionale sulle Armonizzazione (ICH)
• Applicare le linee guida stabilite dalla GCP alle proprie ricerche cliniche ed esperimenti

Pubblico di riferimento

• Clinici investigatori
• Professionisti della ricerca clinica
• Professionisti sanitari e medici
• Personale di supporto per gli esperimenti clinici
• Personale di ricerca e sviluppo

Formato del corso

• Parte lezione, parte discussione, esercizi e pratica intensiva

La genomica microbica e la metagenomica combinano tecnologie di sequenziamento e analisi computazionale per profilare comunità microbiche, caratterizzare genomi e rilevare tratti funzionali come la resistenza agli antibiotici.

Questo corso guidato dal formatore (online o in presenza) è rivolto a ricercatori e bioinformatici di livello base-intermedio che desiderano eseguire analisi pratiche dei dati di sequenziamento genomica microbica e metagenomica.

Al termine di questo corso, i partecipanti saranno in grado di:

• Descrivere flussi di lavoro comuni e formati di file chiave utilizzati nella genomica microbica.
• Eseguire il controllo qualità e la pre-elaborazione dei dati raw NGS.
• Eseguire il profilo tassonomico utilizzando approcci basati su marcatori e k-mer.
• Assemblare e annotare genomi e plasmidi microbici.
• Rilevare SNP, costruire filogenie e interpretare la struttura delle popolazioni.
• Prevedere geni di resistenza agli antibiotici e riassumere i profili funzionali.
• Utilizzare flussi di lavoro riproducibili con Conda, Docker e report basati su notebook.

Formato del Corso

• Lezioni introduttive ai concetti e agli strumenti (20%).
• Sessioni pratiche con set di dati esemplificativi (60%).
• Discussione aperta e analisi guidata per consentire ai partecipanti di applicare i metodi ai loro dati (20%).

Opzioni di Personalizzazione del Corso

• Per richiedere un workshop personalizzato focalizzato su metagenomica clinica, ambientale o industriale, contattateci per organizzare.

Questo corso di formazione guidato dall'instruttore (online o in presenza) è rivolto a scienziati e a chiunque sia interessato a imparare le basi della nanoscienza e delle sue applicazioni.

Al termine di questo training, i partecipanti saranno in grado di:

• Comprendere il campo delle nanoscienze e delle nanotecnologie.
• Distinguere tra elementi a livello nanometrico e microscopico.
• Conoscere la teoria fondamentale del trasferimento di elettroni e energia.

Questo è un corso pratico, che mostra perché la programmazione è uno strumento potente nel contesto della risoluzione di problemi biologici. Durante il corso ai partecipanti verrà insegnato il linguaggio di programmazione Python, un linguaggio ampiamente considerato potente e facile da usare. Questo corso potrebbe essere considerato come una dimostrazione di come la bioinformatica migliori la vita dei biologi.

Il corso è progettato e rivolto a persone senza background informatico che vogliono imparare a programmare.

Questo corso è adatto per:

• Ricercatori che si occupano di dati biologici.
• Scienziati che desiderano imparare ad automatizzare le attività quotidiane e ad analizzare i dati.
• Manager che vogliono imparare come la programmazione migliora i flussi di lavoro e la conduzione dei progetti.

Al termine del corso, i partecipanti saranno in grado di scrivere brevi programmi, che consentiranno loro di manipolare, analizzare e trattare dati biologici e presentare i risultati in un formato grafico.

Questo corso mira a fornire ai ricercatori una comprensione dei principi del disegno statistico e dell'analisi e della loro rilevanza per la ricerca in una vasta gamma di discipline scientifiche.

Tratta alcuni concetti di probabilità e metodi statistici, principalmente attraverso esempi. Questo addestramento contiene circa il 30% di lezioni, il 70% di quiz guidati e laboratori.

Nel caso di un corso chiuso, possiamo personalizzare gli esempi e i materiali per una branca specifica (come test psicologici, settore pubblico, biologia, genetica, ecc...).

Per quanto riguarda i corsi pubblici, si utilizzano esempi misti.

Sebbene vengano utilizzati vari software durante questo corso (Microsoft Excel fino a SPSS, Statgraphics, ecc...), il suo principale focus è sulla comprensione dei principi e processi che guidano la ricerca, il ragionamento e le conclusioni.

Questo corso può essere tenuto come un corso ibrido, cioè con compiti a casa e assegnamenti.