Corso di formazione Fiji: Elaborazione delle immagini per la biotecnologia e la tossicologia

Introduzione a Fiji e ImageJ

• Panoramica di Fiji e delle sue applicazioni nella ricerca scientifica
• Comprensione dell'architettura di ImageJ e dei suoi plug-in
• Installazione e configurazione di Fiji per le massime prestazioni

Tecniche base di elaborazione delle immagini

• Acquisizione delle immagini e formati di importazione
• Regolazione del contrasto, della luminosità e applicazione di filtri
• Creazione di stack di immagini e metodi di proiezione

Analisi avanzata delle immagini

• Tecniche di segmentazione: soglie e rilevamento dei bordi
• Conteggio degli oggetti e analisi delle particelle in campioni istologici
• Misurazione di aree, perimetri e altre caratteristiche morfologiche

Lavorazione di campioni biologici

• Elaborazione di immagini di tessuti istologici, globuli rossi e alghe
• Deconvoluzione dei colori e analisi di tessuti colorati
• Analisi time-lapse e tracciamento del movimento cellulare

Automazione e personalizzazione

• Creazione ed esecuzione di macro per compiti ripetitivi
• Utilizzo dei plug-in di Fiji per analisi specializzate
• Scripting di base con ImageJ Macro Language (IJM)

Gestione dei dati e reportistica

• Esportazione dei risultati e generazione di report
• Annotazione delle immagini e preparazione dei dati per la pubblicazione
• Pratiche corrette per un'analisi delle immagini riproducibile