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Struttura del corso
Introduzione a Fiji e ImageJ
- Panoramica di Fiji e le sue applicazioni nella ricerca scientifica
- Comprendere l'architettura e i plugin di ImageJ
- Installazione e configurazione ottimale di Fiji
Tecniche di Elaborazione delle Immagini di Base
- Acquisizione e importazione delle immagini nei formati corretti
- Regolazione del contrasto, della luminosità e applicazione dei filtri
- Metodi di stacking e proiezione delle immagini
Avanzamenti in Image Analysis
- Tecniche di segmentazione: soglia e rilevamento dei bordi
- Conteggio degli oggetti e analisi delle particelle nei campioni istologici
- Misurazione delle aree, perimetri e altre caratteristiche morfologiche
Lavoro con i Campioni Biologici
- Elaborazione di immagini di tessuti istologici, cellule del sangue e alghe
- Deconvoluzione dei colori ed analisi dei tessuti tinto
- Analisi in laps-tempo e tracciamento del movimento cellulare
Automazione e Personalizzazione
- Creazione ed esecuzione di macro per attività ripetitive
- Utilizzo dei plugin Fiji per analisi specializzate
- Scrittura base con il linguaggio ImageJ Macro (IJM)
Analisi e Rilevazione
- Esportazione dei risultati e generazione di rapporti
- Annotazione delle immagini e preparazione dei dati per la pubblicazione
- Migliori pratiche per l'analisi delle immagini riproducibile
Riepilogo e Prossimi Passi
Requisiti
- Comprendimento basilare dei concetti di imaging biologico
- Familiarità con la microscopia e le tecniche istologiche
- Basica conoscenza del computer
Pubblico
- Ricercatori in biotecnologia ed ecotoxicologia
- Tecnici di laboratorio che lavorano con imaging istologico e cellulare
- Scienziati interessati all'analisi quantitativa delle immagini
14 Ore
