Corso di formazione Fiji: Elaborazione di Immagini per la Biotecnologia e la Tossicologia

Introduzione a Fiji e ImageJ

• Panoramica su Fiji e le sue applicazioni nella ricerca scientifica
• Comprensione dell'architettura di ImageJ e dei plugin
• Installazione e configurazione di Fiji per un funzionamento ottimale

Tecniche di Elaborazione di Immagini di Base

• Acquisizione delle immagini e formati di importazione
• Regolazione del contrasto, della luminosità e applicazione di filtri
• Metodi di stacking e proiezione delle immagini

Analisi Avanzata di Immagini

• Tecniche di segmentazione: sogliamento e rilevamento dei contorni
• Conteggio degli oggetti e analisi delle particelle in campioni istologici
• Misurazione di aree, perimetri e altre caratteristiche morfologiche

Lavorare con Campioni Biologici

• Elaborazione delle immagini di tessuti istologici, cellule del sangue e alghe
• Deconvoluzione del colore e analisi dei tessuti colorati
• Analisi temporale e tracciamento del movimento delle cellule

Automazione e Personalizzazione

• Creazione ed esecuzione di macro per compiti ripetitivi
• Utilizzo dei plugin di Fiji per analisi specializzate
• Scripting di base con il linguaggio Macro di ImageJ (IJM)

Gestione e Reporting dei Dati

• Esportazione dei risultati e generazione di report
• Annotazione delle immagini e preparazione dei dati per la pubblicazione
• Best practice per un'analisi riproducibile delle immagini

Riepilogo e Prossimi Passi