Corso di formazione Fiji: Elaborazione delle immagini per la biotecnologia e la tossicologia

Introduzione a Fiji e ImageJ

• Panoramica su Fiji e le sue applicazioni nella ricerca scientifica
• Approfondimento sull’architettura di ImageJ e sui plugin disponibili
• Procedimenti per l’installazione e la configurazione ottimale di Fiji

Tecniche fondamentali di elaborazione delle immagini

• Acquisizione e formati di importazione delle immagini
• Modifica del contrasto, della luminosità e applicazione di filtri
• Tecniche di sovrapposizione e proiezione delle immagini

Analisi avanzata delle immagini

• Metodi di segmentazione: soglia e rilevamento dei contorni
• Conteggio degli oggetti e analisi delle particelle presenti nei campioni istologici
• Misurazione di aree, perimetri e altre caratteristiche morfologiche

Lavorazione delle immagini biologiche

• Elaborazione di immagini relative a tessuti istologici, cellule sanguinee e alghe
• Deconvoluzione dei colori e analisi dei tessuti colorati
• Analisi temporale delle immagini e tracciamento del movimento cellulare

Automazione e personalizzazione

• Creazione ed esecuzione di macro per compiti ripetitivi
• Utilizzo dei plugin di Fiji finalizzati ad analisi specialistiche
• Nozioni base di programmazione con il linguaggio Macro di ImageJ (IJM)

Gestione dei dati e redazione dei report

• Esportazione dei risultati e generazione di relazioni dettagliate
• Annotazione delle immagini e preparazione dei dati per la pubblicazione
• Linee guida per garantire un’analisi ripetibile e conforme agli standard scientifici

Sintesi finale e prossimi passi