Corso di formazione Basics of Bioinformatics

Questo corso di formazione dal vivo con istruttore in Italia (online o in loco) è rivolto ai biologi che desiderano utilizzare Biopython.

Al termine di questo corso di formazione, i partecipanti saranno in grado di:

• Integrare concetti biologici con le tecnologie dell'informazione per risolvere problemi di ricerca.
• Estrai informazioni da grandi set di dati di origine biologica.
• Crea algoritmi per attività di ricerca essenziali.

Questa formazione guidata dal docente, in Italia (online o in presenza), è rivolta a professionisti sanitari e operatori che desiderano acquisire conoscenze di livello intermedio-avanzato sulle diverse operazioni di sequenziamento genetico e test.

Al termine di questa formazione, i partecipanti saranno in grado di:

• Imparare e comprendere i concetti chiave della genetica.
• Comprendere come funzionano le operazioni di sequenziamento genetico e test.

Buona Pratica Clinica (GCP) è un insieme di linee guida per la ricerca clinica su soggetti umani. GCP costituisce lo standard internazionale per la progettazione, conduzione, monitoraggio, documentazione, analisi e segnalazione degli esperimenti clinici.

In questo corso guidato dal formatore, i partecipanti impareranno le linee guida più importanti e i principi fondamentali applicati nella Buona Pratica Clinica (GCP) per gli esperimenti clinici e le ricerche che coinvolgono soggetti umani. Il corso fornisce un panorama generale delle diverse aree GCP, ma presta una leggera maggiore attenzione alla GCP centrica ICH per i farmaci sperimentali e i biologici.

Al termine di questo training, i partecipanti saranno in grado di:

• Capire i principi fondamentali della GCP per i farmaci sperimentali e i biologici sulla base della Conferenza Internazionale sulle Armonizzazione (ICH)
• Applicare le linee guida stabilite dalla GCP alle proprie ricerche cliniche ed esperimenti

Pubblico di riferimento

• Clinici investigatori
• Professionisti della ricerca clinica
• Professionisti sanitari e medici
• Personale di supporto per gli esperimenti clinici
• Personale di ricerca e sviluppo

Formato del corso

• Parte lezione, parte discussione, esercizi e pratica intensiva

La genomica microbica e la metagenomica combinano tecnologie di sequenziamento e analisi computazionale per profilare comunità microbiche, caratterizzare genomi e rilevare tratti funzionali come la resistenza agli antibiotici.

Questo corso guidato dal formatore (online o in presenza) è rivolto a ricercatori e bioinformatici di livello base-intermedio che desiderano eseguire analisi pratiche dei dati di sequenziamento genomica microbica e metagenomica.

Al termine di questo corso, i partecipanti saranno in grado di:

• Descrivere flussi di lavoro comuni e formati di file chiave utilizzati nella genomica microbica.
• Eseguire il controllo qualità e la pre-elaborazione dei dati raw NGS.
• Eseguire il profilo tassonomico utilizzando approcci basati su marcatori e k-mer.
• Assemblare e annotare genomi e plasmidi microbici.
• Rilevare SNP, costruire filogenie e interpretare la struttura delle popolazioni.
• Prevedere geni di resistenza agli antibiotici e riassumere i profili funzionali.
• Utilizzare flussi di lavoro riproducibili con Conda, Docker e report basati su notebook.

Formato del Corso

• Lezioni introduttive ai concetti e agli strumenti (20%).
• Sessioni pratiche con set di dati esemplificativi (60%).
• Discussione aperta e analisi guidata per consentire ai partecipanti di applicare i metodi ai loro dati (20%).

Opzioni di Personalizzazione del Corso

• Per richiedere un workshop personalizzato focalizzato su metagenomica clinica, ambientale o industriale, contattateci per organizzare.

Questo corso di formazione guidato dall'instruttore (online o in presenza) è rivolto a scienziati e a chiunque sia interessato a imparare le basi della nanoscienza e delle sue applicazioni.

Al termine di questo training, i partecipanti saranno in grado di:

• Comprendere il campo delle nanoscienze e delle nanotecnologie.
• Distinguere tra elementi a livello nanometrico e microscopico.
• Conoscere la teoria fondamentale del trasferimento di elettroni e energia.

Questa formazione live guidata dall'insegnante a Italia (online o presenza) è rivolta a scienziati forensi, geneticisti e antropologi di livello avanzato che desiderano applicare le tecniche NGS alle indagini forensi.

Al termine della formazione, i partecipanti saranno in grado di:

• Comprendere i principi dell'NGS e le sue applicazioni forensi.
• Analizzare campioni di DNA forense utilizzando tecniche NGS.
• Interpretare i dati NGS per l'identificazione umana e la determinazione dell'ascendenza.
• Utilizzare l'NGS in campioni di DNA degradati e complessi.
• Applicare strumenti bioinformatici per l'analisi genomica forense.
• Comprendere le considerazioni legali ed etiche nella genomica forense.

Questo è un corso pratico, che mostra perché la programmazione è uno strumento potente nel contesto della risoluzione di problemi biologici. Durante il corso ai partecipanti verrà insegnato il linguaggio di programmazione Python, un linguaggio ampiamente considerato potente e facile da usare. Questo corso potrebbe essere considerato come una dimostrazione di come la bioinformatica migliori la vita dei biologi.

Il corso è progettato e rivolto a persone senza background informatico che vogliono imparare a programmare.

Questo corso è adatto per:

• Ricercatori che si occupano di dati biologici.
• Scienziati che desiderano imparare ad automatizzare le attività quotidiane e ad analizzare i dati.
• Manager che vogliono imparare come la programmazione migliora i flussi di lavoro e la conduzione dei progetti.

Al termine del corso, i partecipanti saranno in grado di scrivere brevi programmi, che consentiranno loro di manipolare, analizzare e trattare dati biologici e presentare i risultati in un formato grafico.

Questo corso mira a fornire ai ricercatori una comprensione dei principi del disegno statistico e dell'analisi e della loro rilevanza per la ricerca in una vasta gamma di discipline scientifiche.

Tratta alcuni concetti di probabilità e metodi statistici, principalmente attraverso esempi. Questo addestramento contiene circa il 30% di lezioni, il 70% di quiz guidati e laboratori.

Nel caso di un corso chiuso, possiamo personalizzare gli esempi e i materiali per una branca specifica (come test psicologici, settore pubblico, biologia, genetica, ecc...).

Per quanto riguarda i corsi pubblici, si utilizzano esempi misti.

Sebbene vengano utilizzati vari software durante questo corso (Microsoft Excel fino a SPSS, Statgraphics, ecc...), il suo principale focus è sulla comprensione dei principi e processi che guidano la ricerca, il ragionamento e le conclusioni.

Questo corso può essere tenuto come un corso ibrido, cioè con compiti a casa e assegnamenti.